Pepijn van Amersfoort is ook werkzaam als docent en begeleider, waarbij hij studenten begeleidt bij hun afstuderen en afstudeeronderzoek.
Hij heeft vele studenten begeleid bij het afstuderen en het uitvoeren van afstudeeronderzoek. Van 2015 tot 2022 deed hij dit bij de opleiding Social Work aan de Haagse Hogeschool, en sinds 2022 doet hij dit bij de opleiding Integrale Veiligheidskunde aan Inholland Rotterdam.
Pepijn is geregistreerd als docent in het Centraal Register Kort Beroepsonderwijs (CRKBO) en heeft een BKE-certificering (Basis Kwalificatie Examinering)